Por ser la única especie de su género cuyas hembras poseen cuernos, se le clasifica dentro del subgénero Boocercus.
Habita bosques espesos de montaña y bosques de bambú hasta los 4000 m.s.n.m. en grupos de 6 a 8 individuos. Se encuentra en Aberdares, Monte Kenya, bosque del Mau y colinas Cherangani. Muchas de las poblaciones que hoy subsisten han quedado aisladas en parches de bosque rodeados de campo abierto. Hasta hace pocos años era un frecuente visitante de los depósitos de sal junto a los lodges de Aberdares, especialmente The Ark, pero su población ha disminuido, posiblemente debido al acoso de los leones que han proliferado en exceso en este parque.
Principalmente nocturno, aunque parcialmente diurno. De comportamiento muy tímido. Suele vivir en parejas o formar grupos familiares de varias hembras relacionadas y sus crías. En ocasiones se presenta en rebaños de hasta 35 individuos. Los grupos más grandes se forman unos meses después del nacimiento de los terneros y durante la estación seca anterior a las lluvias largas. Estos grupos mayores pueden ser asociaciones temporales de unidades más pequeñas y estables. Los machos adultos son solitarios y solamente se unen a los grupos de hembras durante el apareamiento. La observación del bongo es difícil, ya que permanece oculto en la espesura del bosque, sobre todo en las horas de sol. Se alimenta de noche y en las horas templadas del día. Frecuenta las charcas de barro y los depósitos de sal. La conformación de su cuerpo y sus cortas patas están adaptados al movimiento a través de la maleza densa, donde se desplaza ágilmente con la cabeza agachada y los cuernos extendidos hacia atrás. El bongo no es saltador, prefiere sortear los obstáculos por debajo. Su oído es excelente. Aunque suele mantenerse en silencio, emite un sonido parecido a un balido y su voz de alarma es alta y resonante.
El bongo no es un antílope territorial. Las poblaciones de Aberdares realizan pequeñas migraciones entre las cotas de 2100 y 3100 m.s.n.m.: en las estaciones secas ascienden hasta los bosques de bambú y los altos páramos, mientras que durante las lluvias descienden a los bosques nubosos.